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ingex 試劑盒 TGIRT™ Kit

簡要描述:ingex 試劑盒 TGIRT™ Kit
Ingex, LLC. 的總部,也是TGIRT™-III 獨立酶和TGIRT™ 模板轉(zhuǎn)換 RNA-seq 試劑盒.

  • 產(chǎn)品型號:
  • 廠商性質(zhì):代理商
  • 更新時間:2023-10-08
  • 訪  問  量:1291

詳細介紹

品牌其他品牌供貨周期一個月
應(yīng)用領(lǐng)域醫(yī)療衛(wèi)生,環(huán)保,化工,生物產(chǎn)業(yè),綜合


試劑盒里有什么:


試劑盒含量(10個反應(yīng)或25個反應(yīng)):

TGIRT® -III enzyme, 1 x 10  M l (KTGIRT-10) or 3 x 10  M l (KTGIRT-25)

10XPrimer混合物,50  M l (PM-110)

10 x DTT, 50  M l (D-121)

5x反應(yīng)緩沖區(qū),100  M l (RX-120)

 

  • TGIRT® -III enzyme ,a  RNA和DNA寡核苷酸的混合 (可退火 形成含有R2RNA/R2R異型基因的  第一個適配器序列 ,  dithiothreitol (DTT) ,以及  反應(yīng)緩沖區(qū) 去執(zhí)行 ® 照明rnan及sdnaa-seq分析的模板轉(zhuǎn)換應(yīng)。 這個工具包能夠與第一個rna-后續(xù)適配器無縫連接到cDNA的5'端,合成rna模板的cDNA副本。為香港及香港的  DNA寡核苷酸 (單獨購買)  第二組子適配器序列 必須加到CDNA的3'端  5'微生物/RNA連接酶 (新英格蘭生物學(xué)家;M019或M0319L)在PCR擴增之前。

可以做什么實驗?

1.全面的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組分析。8

2.全細胞、胞外體、血漿和其他無細胞RNA的RNA序列7,8,15

3.miRNA、tRNA和其他非編碼小RNA的分析1-9,12,15

4.RIP-seq、HITS-CLIP、irCLIP和CRAC用于表征RNA-蛋白質(zhì)相互作用和核糖體圖譜。1,10,115

5.通過高通量測序鑒定RNA堿基修飾。4,5,13,14

6.單鏈DNA-序列16

7.FFPE腫瘤樣本分析(咨詢InGex技術(shù)支持)。

以下是您應(yīng)該使用TGIRT的原因:

比逆轉(zhuǎn)錄病毒逆轉(zhuǎn)錄酶具有更高的熱穩(wěn)定性、持續(xù)能力和保真度,允許從高度結(jié)構(gòu)化和/或高度修飾的RNAs(例如tRNAs)和含有富含GC重復(fù)擴增的RNAs進行全長、端到端的cDNA合成。1-9,12,15,17
新的端到端模板轉(zhuǎn)換活性,能夠在逆轉(zhuǎn)錄過程中連接RNA-seq或PCR接頭,并且不需要單獨的拖尾或RNA 3’-接頭連接步驟。1與使用隨機六聚體引物或使用RNA連接酶進行接頭連接的程序相比,這種模板轉(zhuǎn)換活性極大地促進了鏈特異性RNA-seq文庫的構(gòu)建,偏差更小。1,7,8
能夠從低至2 ng的RNA輸入中產(chǎn)生全面的圖譜。7,15
從RNA模板到PCR產(chǎn)物的RNA-seq文庫構(gòu)建需要不到5小時。7,8,15
TGIRT更適合通過tgi rt-模板轉(zhuǎn)換構(gòu)建RNA-seq文庫:

1.全面的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組分析。

去核糖的片段化通用人類參考RNA樣品的TGIRT -seq概括了人類轉(zhuǎn)錄物和刺突蛋白的相對豐度,與非鏈特異性TruSeq v2相當(dāng),且優(yōu)于鏈特異性Tru-Seq v3。TGIRT -seq比TruSeq v3具有更強的鏈特異性,并消除了TruSeq固有的隨機六聚體引發(fā)的取樣偏差。與TruSeq相比,TGIRT -seq顯示了更均勻的5’至3’基因覆蓋范圍,并識別了更多的剪接點。TGIRT -seq能夠在相同的RNA-seq中同時分析mrna和lncRNAs,作為結(jié)構(gòu)化的小ncRNAs,包括trna,它們基本上不存在于TruSeq數(shù)據(jù)集。8

2.人類全細胞、胞外體、血漿和其他細胞外RNA序列。

快速處理時間(通過PCR步驟構(gòu)建RNA-seq文庫< 5小時);需要少量RNA(低ng范圍);全面的轉(zhuǎn)錄譜,包括mRNAs和lncRNAs以及小ncrna,包括tRNAs、前miRNAs和其他結(jié)構(gòu)化小ncrna的全長閱讀;不需要RNA連接酶;與常規(guī)方法相比,偏差更小,效率更高,鏈特異性更強。7,8,15

3.高度結(jié)構(gòu)化和/或高度修飾的RNA模板的RNA-seq。

更高的熱穩(wěn)定性、持續(xù)加工性和鏈置換使得獲得tRNAs和其他結(jié)構(gòu)化/修飾的小ncRNAs的全長、端到端cDNAs成為可能,這些小ncRNAs對逆轉(zhuǎn)錄病毒RTs.4-9,12-15是不可抵抗的。

4.在諸如RIP-seq、HITS-CLIP、irCLIP、CRAC、核糖體分析等方法中通過TGIRT模板轉(zhuǎn)換構(gòu)建RNA-seq文庫。

快速處理時間(通過PCR步驟構(gòu)建RNA-seq文庫< 5小時);需要少量RNA(低ng范圍);不需要RNA連接酶,操作步驟更少,偏差更小,效率更高。1,10,11

5.人血漿和大腸桿菌基因組DNA的ssDNA序列。

通過直接在DNA鏈的3’端啟動DNA合成,同時連接DNA-seq銜接子,無需末端修復(fù)、加尾或連接,以更簡單的工作流程捕獲精確的DNA末端。能夠分析核小體定位、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點、DNA甲基化位點和來源組織。


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